然而就是这次意外失利，让李菊错失了参加雅典奥运会的机会。此后李菊再次退役，在南通从事一段时间的金融工作，后又成立了自己的体育会所。

当时的牛剑锋世界排名第三，排在牛剑锋前面的是张怡宁和王楠，而李菊世界排名第八，排在李菊前面的还有两位外协会选手。

在2003年的世乒赛中，刚刚复出不久的李菊，就打进了世乒赛的女单四强，在半决赛中，李菊不敌张怡宁。但尽管如此，李菊没有输掉一场外战，最终获得了季军，成绩仅次于王楠和张怡宁。

之后，随着邓亚萍逐渐淡出，女乒更新换代全面提速，王楠、李菊、杨影等年轻选手开始在国际赛场上高频率出镜。1997年第二届女子世界杯，国乒派出了王楠、李菊和王晨的阵容，当时“海外兵团”虽余威尚在，但是结合一系列比赛情况，外界普遍看好王楠或李菊将获得世界杯冠军。

第三、雅典奥运会前，当时的张怡宁世界排名第一、王楠世界第二、牛剑锋世界第三，而李菊的排名世界第八，排在她前面的外协选手有鲍罗斯和帖雅娜。也就是说如果李菊前往雅典，那么女乒有50%的可能遭遇八强内战。

李菊进攻能力强，但性子急；王楠防守密不透风，心理素质稳定，两人各有优势。2000年悉尼奥运会，李菊与王楠合作，获得女双冠军。

事后，很多球迷都在猜测，如果是李菊参加奥运会的话，她能不能取得比牛剑锋更好的成绩？当然历史不能更改，这样的假设也没有了任何意义。

李隼表示在东京奥运会之前，派出陈梦和孙颖莎两位从没有打过世界杯的选手出战，其实这是对于她们的考量，尤其李隼表示自己和东道主王楠交谈了很多，她表示如今的国乒女队情况有点类似2000年之前的国乒女队处境，当然的邓亚萍已经退役了，而当时的小将王楠和李菊都没有参加过奥运会，尽管当时1999年世界杯没有举办，但是在之前的世界杯中，王楠和李菊都代表了国乒出战，最终都获得了冠亚军。而在2000年悉尼奥运会中，首次参赛的王楠和李菊最终获得了金牌和银牌。

奥运会后李菊退役了，但2002年，中国女队兵败釜山亚运会，陷入近10年来的最低谷。国家队向李菊发出邀请，她重披国家队战袍。

在世乒赛这样的大赛中，牛剑锋迟迟没有获得出色的成绩，2001年世乒赛，牛剑锋不敌张怡宁止步八强，2003年世乒赛，牛剑锋再一次不敌李菊，再一次止步八强。

而被选中的牛剑锋对此也感到非常意外：论大赛成绩和经验我不如李菊，论年轻冲劲我不如郭跃，我自己都没有想到我能被选中。

平时李菊工作在江苏，丈夫在北京，夫妻俩处于两地分居的状态。李菊很能干，不仅工作出色，而且将家庭照顾得妥帖周到。

然而就是这次意外失利，让李菊错失了参加雅典奥运会的机会。此后李菊再次退役，在南通从事一段时间的金融工作，后又成立了自己的体育会所。